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[硕士论文] 马宇光
生物化学与分子机制 浙江大学 2011(学位年度)
摘要:本研究采用双链特异性DNA酶介导的均一化消减杂交方法比较了海底热液口蟹Gandalfusyunohana和其在普通条件下生存的近缘种三疾梭子蟹Portunustrituberculatus肝胰腺的mRNA,以探求生物在热液口环境中的生存机制。通过构建全长的均一化cDNA消减文库,在GenBank中比对得到51个与已知基因具有相似性的不同转录本。从这些基因之中,我们选取了硫氧还蛋白基因进行了原核表达系统的构建,并对该基因的完整开放阅读框序列进行了确定、分析与表达产物活性的检测。同时,我们通过RACE的手段获得了G.yunohana的热休克蛋白90基因cDNA的完整序列并进行分析,构建了该基因的原核表达系统并在原核细胞中初步验证了该基因在高温胁迫下对细胞的保护作用。这是首次对海底热液口物种的硫氧还蛋白与热休克蛋白90基因信息的报道,我们得到的数据为今后海底热液口生物在特殊环境下的生存机制的研究奠定了基础。
  
[硕士论文] 郭非非
科学技术哲学 华中科技大学 2010(学位年度)
摘要:近年来,随着英美哲学中形而上学研究的兴起和心灵哲学问题讨论的盛行,附生性成为了最重要的哲学概念之一。同时,附生性所具有主题中立的特征使得它在其它学科领域(如伦理学、美学、系统科学)也广受青睐。正是因为如此,人们对各种各样的附生性论题进行了辨析,同时对其成双成对的逻辑关系进行了考证,也审察了它们应用于各个领域的可能性。然而,除了广泛的分析,某些细节还存在问题,还有某些争论并未得到解决。而争论存在的关键可能就在于,是否能够建立起真正的对话语境,使讨论能够在同一标准、同一前提下进行,可见,一个明确而又恰当的附生性概念才是解决问题的关键之所在。我并不试图厘清所有的细节或是解决所有的争论,而是对前人工作中最重要的部分进行梳理,以期获得一个明晰的附生性概念。
   本文主要从三个方面对附生性概念进行了梳理:一是对附生性关系的表述中经常出现的两个关系项(属性和事件)进行比较分析,明确附生性关系的主要关系项是属性;二是对附生性的两种分类方式进行梳理,其中,弱的、强的和全面的附生性分类看似精细,但过于复杂,存在大量问题,而新近用数学中的“对应”概念对附生性作出的分类虽还未完善,但还是很有发展前景的;三是根据现有的主要关系比较分析附生性的本质关系。
[博士论文] 钱俊
流行病与卫生统计学 南方医科大学 2009(学位年度)
摘要:目的和意义: 在生存数据研究中,Cox回归能处理不同生存时间分布的删失数据,无疑是生存分析中最常用最经典的方法。在实际应用中,删失比例很大并应用Cox回归进行生存分析的情形并不鲜见。此时,Cox估计结果的可靠性和准确性如何?Cox模型是否对删失比例没有任何限制?这些问题国内外尚无系统研究的报道。本课题旨在研究删失比例大小对Cox模型分析结果的影响,继而确定应用Cox模型进行生存分析时删失比例的限度。这一问题的解决不仅对删失数据研究具有重要影响,还将为生存分析应用领域提供一个可参考的标准,从而增强危险因素分析的可靠性,提升科学研究结论的质量。 方法: 根据Cox的偏似然算法,回归系数由事件和删失发生的秩序确定,而并非具体的生存时间取值,删失数据的信息只体现在偏似然函数的风险集中。但若删失比例很大,必然导致回归结果的偏倚。本研究将从随机模拟的角度探讨删失数据对Cox模型分析结果的影响,考察Cox回归模型在不同删失比例条件下结果的偏倚性、准确性和有效性。 一、参数设置 1.协变量个数:单因素和多因素情形,多因素情形考虑协变量个数为2、4和8。在多因素情形下,设置部分协变量为无关因素,以考察Cox模型筛选影响因素的能力。 2.生存分布:在已知的生存分布中,只有指数分布、Weibull分布、Gompertz分布满足Cox比例风险假定。分别设置生存时间的分布为以上这3种类型。 3.删失分布:考察Ⅰ型删失和Ⅲ型删失(随机删失)。Ⅰ型删失设置为截尾分布,Ⅲ型删失设置为指数分布和均匀分布。 4.协变量类型:离散型和连续型随机变量,取值分布有两点分布、正态分布、均匀分布、Gamma分布等。 5.样本量大小:以协变量个数的倍数来设置,单因素情形设置为协变量个数的20,40,80……200倍;多因素情形还考虑10倍以及500倍。以样本量和协变量个数倍数的大小来划分,可将样本大小分为3个等级: 样本量为协变量个数的20倍以下,定义为小样本; 样本量为协变量个数的20倍~100倍,定义为中等样本; 样本量为协变量个数的100倍以上,定义为大样本。 6.模拟重复次数:所有参数组合条件下重复抽样500次。 二、评价指标设置 1.偏倚性:回归系数的相对误差(MAD)和回归系数正负性改变的比率(BIAS)。不同删失比例条件下回归系数估计值的相对误差称为MAD,而回归系数估计值的正负号发生改变的比例,以评价指标BIAS标志。MAD和BIAS数值越小,偏倚就越小。 2.准确性:回归系数标准差比率(Stdratio)。不同删失比例条件下回归系数标准差的大小与完整数据下的相比,比值以评价指标Stdratio标志。Stdratio越小(越接近1),结果的准确性越高。 3.有效性:回归结果显著性比率(Propower)。以完整数据的Cox回归结果显著性为前提条件,计算不同删失比例条件下回归结果显著性所占的比例,以指标Propower标志。Propower数值越大,结果的有效性越高。 三、模拟研究过程 1.根据生存时间的分布规律构造出完整数据。 根据不同的生存分布类型,求出累积基准风险函数的反函数,设置不同的分布参数和协变量,产生相应条件下生存时间的完整数据。 2.从完整数据中根据删失数据的分布随机抽样,产生不同删失比例的若干数据集。 先根据删失分布类型和删失比例的设置,运用迭代计算,确定删失分布中参数的取值,然后生成删失时间数据。结合生存时间和删失时间,继而产生不同删失比例下含删失的生存数据集。 3.再以完整数据建立的Cox模型为金标准,从参数估计、显著性检验等方面评价不同删失比例下Cox结果的准确性和可靠性,计算不同删失情形下评价指标数值。 4.对不同删失比例条件下评价指标的变化趋势进行分析。 各项评价指标都是删失比例的单调函数,为了研究单调的特性,引入了差分的概念。一阶差分的正负性代表函数的增减性。二阶差分代表单调变化的加速度,其数值围绕0附近表示函数近似呈线性单调;偏离0越远则函数递增(递减)趋势越大。 结果: 一、结果的偏倚性。 以回归系数的相对误差(MAD)和回归系数正负性改变的比率(BIAS)指标来刻画。 1.在不同生存分布类型和协变量类型下评价指标MAD和BIAS结果类似。 2.在删失分布为Ⅰ型删失(截尾分布)情形下偏倚略小,在Ⅲ型删失各种分布类型下结果近似。 3.受回归系数大小的影响,回归系数越小,MAD数值会越大。 4.随着删失比例的增大,MAD和BIAS数值逐渐增大,在删失较大时会出现加速增大(加速偏倚)的现象。加速偏倚的位置和样本量大小有关: 小样本情形,删失比例在70%后偏倚加速增大; 中等样本情形,删失比例在80%后偏倚加速增大; 大样本情形,删失比例在90%后偏倚加速增大。 二、结果的准确性. 以回归系数标准差的比率(Stdratio)来刻画。 Stdratio的变化主要和删失比例有关:其随着删失比例的增大而不断增大,在删失比例70%时中位数数值达到1.7以上且这种增大趋势会“加速”。Stdratio的增大和加速增大的趋势不受样本量大小的影响,在各种参数条件下数值接近。 三、结果的有效性。 以回归结果显著性比率(Propower)来刻画。 Propower与协变量的标准差、样本量的大小等因素都有关,但它总是随着删失比例的增大而不断下降。 四、极端值的分布 在小样本和大删失的情形下,比较容易出现极端值的现象。取Stdratio数值大于100做为极端值来描述其分布,此时MAD最小值达到4.5,最大值超过1000,Cox回归的估计毫无意义可言。与Ⅲ型删失相比,Ⅰ型删失较少出现极端值现象。在小样本情形下,极端值的出现应引起重视。在单因素情形下,若事件数(死亡例数)小于10,极端值出现的可能性达到5%,若事件数小于6,极端值出现可能性上升到20%。 结论: 删失比例的增大会造成Cox模型分析结果的准确性、有效性下降,偏倚性增大。在删失比例超过70%后,Stdratio中位数数值超过1.7且加速增大,结果的准确性大大下降。指标Propower数值总是随着删失比例的增大而不断下降。 在小样本情形下,删失比例超过70%后,偏倚加速增大且极端值的可能出现应引起重视。中等样本情形下,删失比例超过80%后,偏倚加速增大。大样本情形下,删失比例超过90%后,偏倚加速增大。 为了提高结论的准确性和可靠性,在应用Cox模型进行生存分析时,应检查删失比例是否超过最大限度:样本量为协变量个数20倍以内,删失比例不宜超过70%;样本量为协变量个数20~100倍之间,删失比例不宜超过80%;样本量为协变量个数100倍以上,删失比例不宜超过90%。 总而言之,本研究揭示了删失比例对Cox模型结果的影响,根据课题的研究结果确定了应用Cox模型进行生存分析时删失比例的限度,为实际应用提供了参考依据。
[硕士论文] 周锋
科技哲学 武汉科技大学 2005(学位年度)
摘要:干细胞研究是当代生物科学技术中热点的问题之一,引起各国政府、学术界乃至广大公众的广泛关注。但是,从伦理学的视角研究干细胞问题显得比较薄弱。如何运用伦理学理论来分析和探讨干细胞研究中的伦理问题,并对干细胞研究提出伦理指导原则和管理建议,无疑具有重大的理论意义和现实意义。 本文在第一章对干细胞的概念、干细胞的类型和功能以及干细胞的研究现状和应用前景进行概述,为文章后面的论述提供一个科学背景。 第二章主要分析和探讨各国政府和学者对干细胞的研究态度。由于各国在干细胞研究水平方面的差异和文化传统、宗教信仰、价值观念的不同,各国政府和学者对干细胞研究的态度存在差异。美国、英国政府对干细胞研究主要持“有限”赞同的态度;德国政府对干细胞研究主要持“谨慎”的态度;中国、日本对干细胞研究是一种“审慎支持”的态度。各国学者和公众基于本国的政策以及文化传统对干细胞研究的态度也有不同程度的差异。 第三章重点分析和阐述干细胞研究中的主要伦理问题。作者从“生命”与“人”的界定产生的伦理问题、人类胚胎干细胞来源引起的伦理问题、人类胚胎的克隆性研究中的伦理问题以及干细胞基因治疗中的伦理问题等四个方面对干细胞研究中的伦理问题进行了全面、系统的研究。 第四章从“人”的生物学层面、心理学层面和社会学层面对人类胚胎干细胞的伦理地位进行了伦理审视,作者认为:胚胎是人类生物学生命,不是人类人格生命。但是胚胎具有发展为“社会的人”的潜力,具有一定的价值,应得到应有的尊重,没有充分的理由不能操纵和毁掉。 基于上面的分析和探讨,作者在第五章提出了干细胞研究的行善和救人、尊重和自主、无伤和有利、知情同意、谨慎和保密、安全有效、公平公正、防止商品化等伦理指导原则以及相关的管理建议。
[硕士论文] 李俊
社会医学与卫生事业管理 四川大学华西医学中心;四川大学;华西医科大学 1998(学位年度)
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