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植物小RNA发掘计算及显示软件Screen_miRNA V1.0
成果信息
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  • 公布年份:
    2015
  • 中图分类:
    TP319
  • 关键词:
  • 成果简介:
    开发了Screen_miRNA软件,用于植物miRNA分子的发掘和鉴定。该软件将miRNA对应的前体序列从EST,GSS,Contig等序列中筛选出来,并根据miRNA前体二级折叠图形是否为茎环发夹结构,短读序列是否位于发夹结构的茎臂上,茎臂上短读序列与互补序列是否存在错配,以及折叠构像的最小自由能等结果综合判定短读序列是否是真正的miRNA分子,计算得到的茎环折叠发夹结构以JPG的格式保存在指定目录下。该软件对于判断短读序列是否是真正的miRNA分子具有重要价值,可为从事分子生物学、农学、生物学的科技工作者使用。Sreen_miRNA软件可快速、高效、高通量对植物的短读序列进行miRNA分子的发掘和判定。
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